Genominė biblioteka ir cDNR biblioteka

Autorius: Laura McKinney
Kūrybos Data: 6 Balandis 2021
Atnaujinimo Data: 11 Gegužė 2024
Anonim
Toward the Efficient Discovery of Actionable Chemical Matter from DNA-encoded Libraries
Video.: Toward the Efficient Discovery of Actionable Chemical Matter from DNA-encoded Libraries

Turinys

Genomo biblioteka ir cDNR biblioteka yra naudojamos genų klonavimui, norint išskirti skirtingas DNR. Skirtumas tarp šių abiejų bibliotekų yra tas, kad genomo bibliotekoje yra DNR fragmentai, kurie ekspresuoja visą organizmo genomą, o cDNR bibliotekoje mRNR imama iš tam tikrų organizmo ląstelių, o tada cDNR sudaro ši mRNR reakcijos metu, kuri yra katalizuojama. fermento.


Turinys: Genomo bibliotekos ir cDNA bibliotekos skirtumas

  • Palyginimo diagrama
  • Kas yra genomo biblioteka?
  • Kas yra cDNA biblioteka?
  • Pagrindiniai skirtumai

Palyginimo diagrama

PagrindasGenomo bibliotekacDNA biblioteka
ApibrėžimasGenomo biblioteka yra visos genomo visos organizmo DNR kolekcija. DNR saugoma panašių vektorių populiacijoje, kiekviename jų yra atskiras DNR intarpas.CDNR biblioteka yra klonuotų cDNR fragmentų mišinys, įterptas į ląstelių-šeimininkų atranką, kuri kartu sudaro tam tikrą organizmo transkripto dalį.
IšraiškaVisas genomasTik konkretūs genai.
DydisDidesnisMažesnis
IntronaiDabartinisNėra
VektoriusDideliems fragmentams talpinti naudojama plazmidės, kosmidė, lambda fagas, YAC ir BAC.Tai nėra intronai, todėl plazmidės, fagemidės ir lambda fagos naudoja kuklius fragmentus.

Kas yra genomo biblioteka?

Atliekant genų klonavimą, dominantis genas nukopijuojamas nuo DNR, atskirtos nuo organizmo. Kai DNR yra atskirta nuo organizmo, jo genai buvo ekstrahuojami vienu metu. Organizmo DNR susideda iš tūkstančių skirtingų genų. Genetikos inžinierius suranda vieną specifinį geną, kuris koduoja tam tikrą dominantį baltymą.


Visiškai nėra vieno metodo, kuriuo remiantis būtų galima gauti tam tikrą geną iš DNR, todėl mokslininkai sukuria genų bibliotekas, kad kataloguotų organizmo DNR. Tada mokslininkai išsirinks norimą geną bibliotekoje. Genų biblioteka yra grupė gyvų bakterijų kolonijų, kurios organizme yra transformuotos unikaliais DNR vienetais, kurie yra norimo geno kilmės. DNR iš organizmo yra išgaunama, norint sukurti biblioteką, kuri yra organizuota DNR forma. Genominė biblioteka ir cDNR yra dviejų rūšių genų bibliotekos. Rekombinantinėje technologijoje kaip genų strategijos buvo panaudota daugybė genų klonavimo metodų.

DNR fragmentai yra atskirti pjaustant specifiniais restrikcijos fermentais iš pirminės DNR. Šie fragmentai yra sujungti su vektorių molekulėmis, o susikaupusios molekulės perkeliamos į ląsteles-šeimininkę, po 1 molekulę kiekvienoje ląstelėje. Genominę biblioteką sudaro intronai, nepageidaujama DNR ir daugybė kitų fragmentų. Šioje bibliotekoje DNR suskaidoma į mažesnius fragmentus ląstelės viduje. Po to visos mažos dalys įterpiamos į vektorių, kad būtų sukurta biblioteka. Genominę biblioteką sudaro visos genų DNR, o ląstelė - visi jų intronai. Genominė DNR yra viso genomo vertimas. Dėl intronų dydžio jis nekoduoja visos kodono dalies. Genominėje bibliotekoje nėra jokio sujungimo mechanizmo, dėl kurio būtų sunku išreikšti iš šios bibliotekos paimtus genus.


Kas yra cDNA biblioteka?

cDNR biblioteka sudaroma parenkant vieną audinio ar ląstelės tipą. Vėliau mRNR išskiriama iš to audinio ar ląstelės. MRNR molekulės DNR kopiją sudaro specifinis fermentas atvirkštinės transkriptazės fermentas. Taigi cDNR bibliotekoje yra ta specifinė DNR, esanti mRNR. Šioje bibliotekoje nerasta nei intronų, nei DNR sekos. Šioje bibliotekoje visi klonai yra viso ilgio. Be to, cDNR klonas yra būtinas transfekuoti ląsteles baltymų gamybai arba ląstelių pagrindu atliekamiems tyrimams.

Pagrindiniai skirtumai

  1. Genomo biblioteka buvo parašyta tiesiogiai iš genomo DNR.
  2. cDNR biblioteka buvo suformuota naudojant mRNR kaip šabloną.
  3. Genominė biblioteka užima visą šio organizmo genomą.
  4. cDNR biblioteka žymi tik tam tikrų negalavimų genus.
  5. Du fermentai, restrikcijos endonukleazės ir ligazės, yra svarbūs genomo bibliotekos statybai.
  6. Atvirkštinis transkriptazės fermentas vaidina svarbų vaidmenį kuriant cDNR biblioteką.
  7. Genominė biblioteka užima tiek prokariotinių, tiek eukariotinių organizmų DNR.
  8. cDNR biblioteka parodo tik eukariotų organizmų DNR.
  9. cDNR biblioteka yra pajėgi genomo ekspresijai bakterijose, kurios yra prokariotinės, nes jose trūksta intronų.
  10. Genominė biblioteka negali pasakyti apie prokariotinį organizmą, nes jie turi intronus, o prokariotinis organizmas neturi mašinų intronams apdoroti.